Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrphP15331 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrphP15331 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms