Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FosbP13346 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FosbP13346 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FosbP13346 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FosbP13346 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FosbP13346 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FosbP13346 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FosbP13346 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms