Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms