Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms