Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
H2-Ab1P01921 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-Ab1P01921 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms