Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01734 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01734 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01734 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms