Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Mtatp6P00848 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mtatp6P00848 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms