Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms