Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lnx1O70263 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms