Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms