Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms