Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zmat3O54836 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zmat3O54836 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms