Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffaO54786 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffaO54786 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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