Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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