Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cops5O35864 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops5O35864 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops5O35864 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cops5O35864 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cops5O35864 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cops5O35864 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops5O35864 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cops5O35864 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops5O35864 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops5O35864 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cops5O35864 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops5O35864 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Cops5O35864 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops5O35864 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cops5O35864 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cops5O35864 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cops5O35864 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cops5O35864 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cops5O35864 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms