Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfibp2O35711 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms