Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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