Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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