Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edil3O35474 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms