Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccrl2O35457 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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