Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms