Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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H2-ObO35424 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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H2-ObO35424 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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H2-ObO35424 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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