Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Abcc1O35379 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Abcc1O35379 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Abcc1O35379 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Abcc1O35379 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Abcc1O35379 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Abcc1O35379 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc1O35379 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Abcc1O35379 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Abcc1O35379 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Abcc1O35379 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Abcc1O35379 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcc1O35379 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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