Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ColqO35348 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ColqO35348 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ColqO35348 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms