Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad6O35182 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms