Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcns1O35173 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcns1O35173 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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