Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Scarb2O35114 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Scarb2O35114 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Scarb2O35114 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Scarb2O35114 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Scarb2O35114 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Scarb2O35114 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Scarb2O35114 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Scarb2O35114 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Scarb2O35114 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Scarb2O35114 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Scarb2O35114 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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