Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sypl1O09117 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sypl1O09117 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms