Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltaO08585 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltaO08585 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltaO08585 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltaO08585 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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