Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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