Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Usp35M0QWN7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Usp35M0QWN7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Usp35M0QWN7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp35M0QWN7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp35M0QWN7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp35M0QWN7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp35M0QWN7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp35M0QWN7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp35M0QWN7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp35M0QWN7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Usp35M0QWN7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Usp35M0QWN7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp35M0QWN7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp35M0QWN7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp35M0QWN7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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