Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms