Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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