Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccer2J3QPU5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms