Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc180J3QNE4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms