Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms