Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK1

Sgo2b, Shugoshin 2B, mousemouse

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Length 1,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2bJ3QMK1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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