Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm17535J3KMR8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm17535J3KMR8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm17535J3KMR8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm17535J3KMR8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm17535J3KMR8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm17535J3KMR8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm17535J3KMR8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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