Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms