Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Vmn1r167G3UW71 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Vmn1r167G3UW71 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Vmn1r167G3UW71 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Vmn1r167G3UW71 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Vmn1r167G3UW71 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r167G3UW71 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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