Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LctF8VPT3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms