Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms