Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms