Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms