Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms