Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms