Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms