Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc146E9Q9F7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms