Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms