Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef5E9Q7D5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms